Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALRP27797 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CALRP27797 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALRP27797 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CALRP27797 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALRP27797 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CALRP27797 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALRP27797 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALRP27797 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALRP27797 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALRP27797 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CALRP27797 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CALRP27797 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALRP27797 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CALRP27797 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CALRP27797 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CALRP27797 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CALRP27797 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALRP27797 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALRP27797 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CALRP27797 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALRP27797 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALRP27797 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALRP27797 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALRP27797 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALRP27797 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALRP27797 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALRP27797 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALRP27797 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALRP27797 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALRP27797 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALRP27797 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALRP27797 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALRP27797 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALRP27797 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALRP27797 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALRP27797 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALRP27797 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALRP27797 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALRP27797 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALRP27797 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALRP27797 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALRP27797 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALRP27797 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALRP27797 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALRP27797 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALRP27797 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALRP27797 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALRP27797 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALRP27797 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALRP27797 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALRP27797 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALRP27797 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALRP27797 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALRP27797 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALRP27797 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALRP27797 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALRP27797 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALRP27797 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALRP27797 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALRP27797 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALRP27797 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALRP27797 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALRP27797 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALRP27797 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALRP27797 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALRP27797 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALRP27797 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALRP27797 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALRP27797 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALRP27797 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALRP27797 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALRP27797 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALRP27797 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALRP27797 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALRP27797 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALRP27797 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALRP27797 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALRP27797 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALRP27797 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALRP27797 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALRP27797 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALRP27797 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALRP27797 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALRP27797 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALRP27797 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALRP27797 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALRP27797 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALRP27797 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALRP27797 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CALRP27797 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALRP27797 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CALRP27797 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALRP27797 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALRP27797 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALRP27797 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALRP27797 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALRP27797 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALRP27797 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CALRP27797 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms