Protein–RNA interactions for Protein: P26572

MGAT1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT1P26572 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGAT1P26572 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms