Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
CCNE1P24864 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms