Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPH2P23942 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPH2P23942 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPH2P23942 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRPH2P23942 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms