Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
PTPRGP23470 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
PTPRGP23470 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRGP23470 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
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