Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA6P23229 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGA6P23229 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGA6P23229 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms