Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C4BPBP20851 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BPBP20851 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms