Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASTP20810 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASTP20810 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASTP20810 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASTP20810 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASTP20810 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASTP20810 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASTP20810 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASTP20810 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASTP20810 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASTP20810 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASTP20810 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASTP20810 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASTP20810 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASTP20810 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASTP20810 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASTP20810 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CASTP20810 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CASTP20810 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASTP20810 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASTP20810 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASTP20810 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASTP20810 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASTP20810 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASTP20810 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASTP20810 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CASTP20810 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASTP20810 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CASTP20810 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASTP20810 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASTP20810 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASTP20810 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASTP20810 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASTP20810 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASTP20810 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASTP20810 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASTP20810 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASTP20810 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASTP20810 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CASTP20810 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASTP20810 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASTP20810 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CASTP20810 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASTP20810 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASTP20810 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASTP20810 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASTP20810 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASTP20810 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASTP20810 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASTP20810 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASTP20810 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASTP20810 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASTP20810 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASTP20810 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASTP20810 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASTP20810 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASTP20810 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASTP20810 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASTP20810 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASTP20810 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASTP20810 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASTP20810 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASTP20810 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASTP20810 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASTP20810 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASTP20810 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASTP20810 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASTP20810 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASTP20810 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASTP20810 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASTP20810 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASTP20810 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASTP20810 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASTP20810 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASTP20810 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CASTP20810 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CASTP20810 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASTP20810 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CASTP20810 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASTP20810 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASTP20810 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASTP20810 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASTP20810 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASTP20810 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASTP20810 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASTP20810 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASTP20810 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASTP20810 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CASTP20810 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASTP20810 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASTP20810 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASTP20810 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASTP20810 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASTP20810 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASTP20810 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASTP20810 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASTP20810 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASTP20810 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASTP20810 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASTP20810 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms