Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD33P20138 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD33P20138 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD33P20138 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD33P20138 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CD33P20138 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CD33P20138 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD33P20138 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD33P20138 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD33P20138 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD33P20138 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD33P20138 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD33P20138 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD33P20138 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD33P20138 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD33P20138 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD33P20138 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD33P20138 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD33P20138 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD33P20138 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD33P20138 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD33P20138 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD33P20138 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD33P20138 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD33P20138 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD33P20138 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CD33P20138 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD33P20138 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD33P20138 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CD33P20138 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD33P20138 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD33P20138 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD33P20138 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD33P20138 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD33P20138 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD33P20138 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD33P20138 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD33P20138 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD33P20138 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD33P20138 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD33P20138 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CD33P20138 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD33P20138 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD33P20138 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD33P20138 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD33P20138 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD33P20138 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD33P20138 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD33P20138 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD33P20138 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD33P20138 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD33P20138 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD33P20138 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD33P20138 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD33P20138 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD33P20138 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD33P20138 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CD33P20138 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD33P20138 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD33P20138 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD33P20138 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD33P20138 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD33P20138 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD33P20138 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD33P20138 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD33P20138 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD33P20138 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD33P20138 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD33P20138 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD33P20138 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD33P20138 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD33P20138 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD33P20138 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD33P20138 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD33P20138 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD33P20138 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD33P20138 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD33P20138 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD33P20138 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD33P20138 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD33P20138 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD33P20138 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD33P20138 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD33P20138 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD33P20138 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD33P20138 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD33P20138 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD33P20138 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD33P20138 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD33P20138 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD33P20138 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD33P20138 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD33P20138 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD33P20138 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD33P20138 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD33P20138 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD33P20138 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CD33P20138 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD33P20138 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD33P20138 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms