Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC3P19447 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC3P19447 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms