Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms