Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH2P19022 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH2P19022 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH2P19022 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH2P19022 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDH2P19022 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDH2P19022 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDH2P19022 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDH2P19022 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDH2P19022 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH2P19022 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH2P19022 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH2P19022 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH2P19022 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH2P19022 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH2P19022 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH2P19022 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH2P19022 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH2P19022 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH2P19022 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH2P19022 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH2P19022 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH2P19022 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH2P19022 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH2P19022 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH2P19022 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH2P19022 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH2P19022 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH2P19022 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH2P19022 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH2P19022 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH2P19022 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH2P19022 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH2P19022 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH2P19022 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH2P19022 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH2P19022 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH2P19022 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH2P19022 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH2P19022 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH2P19022 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH2P19022 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH2P19022 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH2P19022 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH2P19022 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH2P19022 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH2P19022 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH2P19022 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH2P19022 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH2P19022 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH2P19022 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH2P19022 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH2P19022 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH2P19022 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH2P19022 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH2P19022 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH2P19022 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH2P19022 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH2P19022 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH2P19022 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH2P19022 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH2P19022 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH2P19022 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH2P19022 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH2P19022 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH2P19022 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH2P19022 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH2P19022 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH2P19022 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH2P19022 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH2P19022 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH2P19022 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH2P19022 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH2P19022 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH2P19022 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH2P19022 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH2P19022 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH2P19022 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH2P19022 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH2P19022 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH2P19022 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH2P19022 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH2P19022 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH2P19022 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH2P19022 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH2P19022 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH2P19022 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH2P19022 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH2P19022 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH2P19022 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH2P19022 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH2P19022 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH2P19022 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH2P19022 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH2P19022 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH2P19022 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH2P19022 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH2P19022 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH2P19022 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH2P19022 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms