Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL17P18621 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL17P18621 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL17P18621 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL17P18621 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL17P18621 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL17P18621 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL17P18621 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL17P18621 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL17P18621 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL17P18621 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL17P18621 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL17P18621 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL17P18621 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL17P18621 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL17P18621 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL17P18621 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL17P18621 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL17P18621 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL17P18621 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL17P18621 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL17P18621 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL17P18621 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL17P18621 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL17P18621 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL17P18621 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL17P18621 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL17P18621 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL17P18621 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL17P18621 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL17P18621 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL17P18621 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL17P18621 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL17P18621 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL17P18621 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL17P18621 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL17P18621 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL17P18621 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL17P18621 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL17P18621 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL17P18621 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL17P18621 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL17P18621 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL17P18621 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL17P18621 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL17P18621 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL17P18621 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL17P18621 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL17P18621 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL17P18621 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL17P18621 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL17P18621 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL17P18621 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL17P18621 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL17P18621 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL17P18621 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL17P18621 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL17P18621 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL17P18621 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL17P18621 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL17P18621 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL17P18621 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL17P18621 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL17P18621 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL17P18621 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL17P18621 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL17P18621 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL17P18621 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL17P18621 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL17P18621 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL17P18621 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL17P18621 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL17P18621 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL17P18621 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL17P18621 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL17P18621 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL17P18621 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL17P18621 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL17P18621 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL17P18621 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL17P18621 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL17P18621 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL17P18621 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL17P18621 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL17P18621 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL17P18621 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL17P18621 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL17P18621 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL17P18621 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL17P18621 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL17P18621 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL17P18621 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL17P18621 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL17P18621 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL17P18621 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL17P18621 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL17P18621 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL17P18621 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL17P18621 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL17P18621 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms