Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR1P18146 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR1P18146 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR1P18146 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR1P18146 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR1P18146 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR1P18146 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR1P18146 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR1P18146 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EGR1P18146 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EGR1P18146 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EGR1P18146 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EGR1P18146 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EGR1P18146 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EGR1P18146 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EGR1P18146 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EGR1P18146 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EGR1P18146 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EGR1P18146 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR1P18146 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR1P18146 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR1P18146 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR1P18146 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR1P18146 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR1P18146 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR1P18146 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR1P18146 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR1P18146 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR1P18146 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR1P18146 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR1P18146 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR1P18146 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR1P18146 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR1P18146 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR1P18146 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR1P18146 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR1P18146 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR1P18146 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR1P18146 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR1P18146 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR1P18146 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR1P18146 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR1P18146 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR1P18146 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR1P18146 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR1P18146 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR1P18146 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR1P18146 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR1P18146 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR1P18146 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR1P18146 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR1P18146 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR1P18146 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR1P18146 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR1P18146 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR1P18146 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR1P18146 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR1P18146 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR1P18146 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR1P18146 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR1P18146 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR1P18146 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR1P18146 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR1P18146 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR1P18146 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR1P18146 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR1P18146 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR1P18146 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR1P18146 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR1P18146 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR1P18146 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
EGR1P18146 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EGR1P18146 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EGR1P18146 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR1P18146 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR1P18146 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms