Protein–RNA interactions for Protein: P17066

HSPA6, Heat shock 70 kDa protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA6P17066 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HSPA6P17066 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSPA6P17066 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms