Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms