Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRAP16234 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDGFRAP16234 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms