Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD44P16070 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD44P16070 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD44P16070 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD44P16070 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD44P16070 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD44P16070 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD44P16070 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD44P16070 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD44P16070 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD44P16070 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD44P16070 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD44P16070 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD44P16070 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD44P16070 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD44P16070 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD44P16070 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD44P16070 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD44P16070 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD44P16070 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD44P16070 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD44P16070 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD44P16070 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD44P16070 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD44P16070 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD44P16070 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD44P16070 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD44P16070 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD44P16070 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD44P16070 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD44P16070 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD44P16070 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD44P16070 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD44P16070 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD44P16070 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD44P16070 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD44P16070 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD44P16070 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD44P16070 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD44P16070 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD44P16070 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD44P16070 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD44P16070 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD44P16070 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD44P16070 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD44P16070 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CD44P16070 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD44P16070 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD44P16070 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD44P16070 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD44P16070 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD44P16070 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD44P16070 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD44P16070 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD44P16070 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD44P16070 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD44P16070 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD44P16070 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD44P16070 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD44P16070 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD44P16070 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD44P16070 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD44P16070 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD44P16070 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD44P16070 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD44P16070 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD44P16070 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD44P16070 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD44P16070 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD44P16070 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD44P16070 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD44P16070 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD44P16070 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD44P16070 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD44P16070 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CD44P16070 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CD44P16070 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD44P16070 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD44P16070 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD44P16070 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD44P16070 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD44P16070 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD44P16070 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD44P16070 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD44P16070 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD44P16070 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD44P16070 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD44P16070 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CD44P16070 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD44P16070 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD44P16070 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD44P16070 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD44P16070 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD44P16070 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD44P16070 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD44P16070 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD44P16070 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD44P16070 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD44P16070 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD44P16070 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms