Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA1P15976 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA1P15976 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA1P15976 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA1P15976 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA1P15976 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA1P15976 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA1P15976 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA1P15976 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA1P15976 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA1P15976 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA1P15976 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA1P15976 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA1P15976 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA1P15976 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA1P15976 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA1P15976 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA1P15976 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA1P15976 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA1P15976 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA1P15976 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA1P15976 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA1P15976 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA1P15976 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA1P15976 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA1P15976 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA1P15976 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA1P15976 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA1P15976 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA1P15976 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA1P15976 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA1P15976 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA1P15976 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA1P15976 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA1P15976 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA1P15976 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA1P15976 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA1P15976 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA1P15976 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA1P15976 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA1P15976 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA1P15976 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA1P15976 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA1P15976 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA1P15976 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA1P15976 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA1P15976 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA1P15976 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA1P15976 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA1P15976 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA1P15976 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA1P15976 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA1P15976 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA1P15976 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA1P15976 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA1P15976 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA1P15976 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA1P15976 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA1P15976 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA1P15976 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA1P15976 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA1P15976 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA1P15976 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA1P15976 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA1P15976 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA1P15976 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA1P15976 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA1P15976 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA1P15976 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA1P15976 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA1P15976 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA1P15976 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA1P15976 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA1P15976 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA1P15976 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA1P15976 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA1P15976 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms