Protein–RNA interactions for Protein: P13591

NCAM1, Neural cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM1P13591 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCAM1P13591 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms