Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX4I1P13073 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms