Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VDRP11473 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VDRP11473 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VDRP11473 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VDRP11473 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VDRP11473 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VDRP11473 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VDRP11473 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VDRP11473 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VDRP11473 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VDRP11473 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VDRP11473 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VDRP11473 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VDRP11473 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VDRP11473 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VDRP11473 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VDRP11473 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VDRP11473 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VDRP11473 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VDRP11473 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VDRP11473 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VDRP11473 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VDRP11473 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VDRP11473 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VDRP11473 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VDRP11473 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VDRP11473 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VDRP11473 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VDRP11473 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VDRP11473 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VDRP11473 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VDRP11473 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VDRP11473 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VDRP11473 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VDRP11473 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VDRP11473 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VDRP11473 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VDRP11473 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VDRP11473 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VDRP11473 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VDRP11473 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VDRP11473 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VDRP11473 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VDRP11473 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VDRP11473 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VDRP11473 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VDRP11473 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VDRP11473 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VDRP11473 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VDRP11473 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VDRP11473 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VDRP11473 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VDRP11473 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VDRP11473 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VDRP11473 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VDRP11473 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VDRP11473 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VDRP11473 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VDRP11473 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VDRP11473 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VDRP11473 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VDRP11473 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VDRP11473 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VDRP11473 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VDRP11473 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VDRP11473 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VDRP11473 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VDRP11473 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VDRP11473 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VDRP11473 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VDRP11473 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VDRP11473 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VDRP11473 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VDRP11473 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VDRP11473 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VDRP11473 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VDRP11473 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VDRP11473 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VDRP11473 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VDRP11473 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VDRP11473 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VDRP11473 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VDRP11473 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VDRP11473 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VDRP11473 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VDRP11473 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VDRP11473 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VDRP11473 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VDRP11473 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VDRP11473 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VDRP11473 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VDRP11473 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VDRP11473 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VDRP11473 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VDRP11473 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VDRP11473 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VDRP11473 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VDRP11473 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VDRP11473 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VDRP11473 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms