Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGBP11216 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGBP11216 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGBP11216 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGBP11216 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGBP11216 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGBP11216 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGBP11216 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGBP11216 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGBP11216 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGBP11216 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGBP11216 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGBP11216 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGBP11216 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGBP11216 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGBP11216 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGBP11216 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGBP11216 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGBP11216 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGBP11216 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGBP11216 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGBP11216 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGBP11216 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGBP11216 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGBP11216 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGBP11216 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGBP11216 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PYGBP11216 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PYGBP11216 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PYGBP11216 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PYGBP11216 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PYGBP11216 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PYGBP11216 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PYGBP11216 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PYGBP11216 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGBP11216 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGBP11216 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGBP11216 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGBP11216 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGBP11216 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGBP11216 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGBP11216 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGBP11216 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGBP11216 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGBP11216 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGBP11216 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYGBP11216 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYGBP11216 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PYGBP11216 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYGBP11216 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYGBP11216 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYGBP11216 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYGBP11216 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYGBP11216 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYGBP11216 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYGBP11216 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PYGBP11216 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PYGBP11216 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PYGBP11216 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PYGBP11216 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PYGBP11216 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PYGBP11216 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PYGBP11216 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PYGBP11216 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PYGBP11216 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PYGBP11216 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PYGBP11216 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PYGBP11216 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PYGBP11216 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PYGBP11216 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PYGBP11216 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PYGBP11216 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PYGBP11216 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PYGBP11216 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PYGBP11216 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PYGBP11216 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PYGBP11216 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PYGBP11216 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PYGBP11216 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PYGBP11216 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PYGBP11216 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PYGBP11216 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PYGBP11216 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PYGBP11216 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PYGBP11216 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PYGBP11216 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PYGBP11216 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PYGBP11216 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PYGBP11216 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PYGBP11216 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PYGBP11216 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PYGBP11216 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PYGBP11216 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PYGBP11216 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYGBP11216 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYGBP11216 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYGBP11216 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYGBP11216 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYGBP11216 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYGBP11216 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms