Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM13P0DJ93 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms