Protein–RNA interactions for Protein: P0CL83

STAG3L1, Putative STAG3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L1P0CL83 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAG3L1P0CL83 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAG3L1P0CL83 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAG3L1P0CL83 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAG3L1P0CL83 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAG3L1P0CL83 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STAG3L1P0CL83 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
STAG3L1P0CL83 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STAG3L1P0CL83 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STAG3L1P0CL83 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG3L1P0CL83 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG3L1P0CL83 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG3L1P0CL83 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG3L1P0CL83 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG3L1P0CL83 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAG3L1P0CL83 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STAG3L1P0CL83 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STAG3L1P0CL83 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STAG3L1P0CL83 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STAG3L1P0CL83 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STAG3L1P0CL83 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STAG3L1P0CL83 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STAG3L1P0CL83 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAG3L1P0CL83 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms