Protein–RNA interactions for Protein: P0CG36

CFC1B, Cryptic family protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1BP0CG36 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms