Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC172P0C7W6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms