Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPSAP08865 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPSAP08865 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPSAP08865 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPSAP08865 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPSAP08865 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPSAP08865 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPSAP08865 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPSAP08865 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPSAP08865 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPSAP08865 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPSAP08865 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPSAP08865 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPSAP08865 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPSAP08865 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPSAP08865 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPSAP08865 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPSAP08865 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPSAP08865 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPSAP08865 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPSAP08865 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPSAP08865 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPSAP08865 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPSAP08865 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPSAP08865 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPSAP08865 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPSAP08865 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPSAP08865 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPSAP08865 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPSAP08865 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPSAP08865 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPSAP08865 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPSAP08865 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPSAP08865 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPSAP08865 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPSAP08865 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPSAP08865 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPSAP08865 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPSAP08865 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPSAP08865 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPSAP08865 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPSAP08865 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPSAP08865 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPSAP08865 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPSAP08865 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPSAP08865 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPSAP08865 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPSAP08865 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPSAP08865 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPSAP08865 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPSAP08865 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPSAP08865 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPSAP08865 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPSAP08865 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPSAP08865 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPSAP08865 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPSAP08865 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPSAP08865 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPSAP08865 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPSAP08865 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPSAP08865 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPSAP08865 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPSAP08865 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPSAP08865 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPSAP08865 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPSAP08865 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPSAP08865 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPSAP08865 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPSAP08865 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPSAP08865 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPSAP08865 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPSAP08865 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPSAP08865 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPSAP08865 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPSAP08865 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPSAP08865 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPSAP08865 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPSAP08865 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPSAP08865 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPSAP08865 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPSAP08865 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPSAP08865 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPSAP08865 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPSAP08865 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPSAP08865 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPSAP08865 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPSAP08865 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPSAP08865 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPSAP08865 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPSAP08865 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPSAP08865 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPSAP08865 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPSAP08865 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPSAP08865 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPSAP08865 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPSAP08865 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPSAP08865 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPSAP08865 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPSAP08865 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPSAP08865 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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