Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYBBP04839 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYBBP04839 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYBBP04839 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYBBP04839 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYBBP04839 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CYBBP04839 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CYBBP04839 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYBBP04839 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYBBP04839 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYBBP04839 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYBBP04839 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYBBP04839 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYBBP04839 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYBBP04839 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYBBP04839 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYBBP04839 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYBBP04839 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYBBP04839 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CYBBP04839 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYBBP04839 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYBBP04839 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYBBP04839 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYBBP04839 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYBBP04839 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYBBP04839 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYBBP04839 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYBBP04839 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYBBP04839 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYBBP04839 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYBBP04839 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CYBBP04839 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYBBP04839 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYBBP04839 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYBBP04839 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYBBP04839 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYBBP04839 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYBBP04839 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYBBP04839 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYBBP04839 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYBBP04839 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYBBP04839 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYBBP04839 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYBBP04839 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYBBP04839 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYBBP04839 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CYBBP04839 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYBBP04839 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYBBP04839 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYBBP04839 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYBBP04839 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYBBP04839 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYBBP04839 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYBBP04839 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CYBBP04839 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYBBP04839 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYBBP04839 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYBBP04839 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYBBP04839 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYBBP04839 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYBBP04839 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CYBBP04839 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYBBP04839 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYBBP04839 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYBBP04839 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYBBP04839 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYBBP04839 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYBBP04839 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CYBBP04839 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYBBP04839 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYBBP04839 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYBBP04839 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYBBP04839 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYBBP04839 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYBBP04839 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYBBP04839 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYBBP04839 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CYBBP04839 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYBBP04839 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYBBP04839 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYBBP04839 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYBBP04839 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYBBP04839 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYBBP04839 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYBBP04839 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CYBBP04839 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYBBP04839 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYBBP04839 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYBBP04839 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYBBP04839 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYBBP04839 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYBBP04839 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYBBP04839 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYBBP04839 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYBBP04839 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CYBBP04839 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CYBBP04839 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYBBP04839 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYBBP04839 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CYBBP04839 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms