Protein–RNA interactions for Protein: P04049

RAF1, RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAF1P04049 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAF1P04049 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAF1P04049 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAF1P04049 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAF1P04049 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAF1P04049 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAF1P04049 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAF1P04049 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAF1P04049 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAF1P04049 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAF1P04049 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAF1P04049 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAF1P04049 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAF1P04049 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAF1P04049 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAF1P04049 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAF1P04049 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAF1P04049 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAF1P04049 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAF1P04049 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAF1P04049 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAF1P04049 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAF1P04049 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAF1P04049 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAF1P04049 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAF1P04049 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAF1P04049 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAF1P04049 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAF1P04049 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAF1P04049 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAF1P04049 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAF1P04049 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAF1P04049 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAF1P04049 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAF1P04049 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAF1P04049 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAF1P04049 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAF1P04049 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAF1P04049 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAF1P04049 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAF1P04049 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAF1P04049 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAF1P04049 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAF1P04049 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAF1P04049 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAF1P04049 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAF1P04049 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAF1P04049 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAF1P04049 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAF1P04049 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAF1P04049 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAF1P04049 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAF1P04049 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAF1P04049 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAF1P04049 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAF1P04049 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAF1P04049 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAF1P04049 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAF1P04049 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAF1P04049 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAF1P04049 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAF1P04049 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAF1P04049 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAF1P04049 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAF1P04049 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAF1P04049 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAF1P04049 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAF1P04049 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAF1P04049 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAF1P04049 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAF1P04049 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAF1P04049 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAF1P04049 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAF1P04049 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAF1P04049 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAF1P04049 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAF1P04049 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAF1P04049 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAF1P04049 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAF1P04049 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAF1P04049 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAF1P04049 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAF1P04049 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAF1P04049 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAF1P04049 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAF1P04049 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAF1P04049 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAF1P04049 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAF1P04049 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAF1P04049 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAF1P04049 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAF1P04049 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAF1P04049 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAF1P04049 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAF1P04049 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAF1P04049 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAF1P04049 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAF1P04049 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAF1P04049 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAF1P04049 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms