Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGGP02679 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGGP02679 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGGP02679 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGGP02679 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGGP02679 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGGP02679 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGGP02679 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGGP02679 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGGP02679 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGGP02679 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FGGP02679 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGGP02679 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FGGP02679 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGGP02679 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGGP02679 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGGP02679 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGGP02679 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGGP02679 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGGP02679 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGGP02679 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGGP02679 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGGP02679 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGGP02679 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGGP02679 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGGP02679 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGGP02679 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGGP02679 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGGP02679 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGGP02679 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGGP02679 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGGP02679 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGGP02679 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGGP02679 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGGP02679 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGGP02679 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGGP02679 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGGP02679 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGGP02679 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGGP02679 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGGP02679 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FGGP02679 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGGP02679 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FGGP02679 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGGP02679 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGGP02679 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGGP02679 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGGP02679 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGGP02679 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGGP02679 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGGP02679 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGGP02679 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FGGP02679 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGGP02679 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGGP02679 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGGP02679 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FGGP02679 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGGP02679 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGGP02679 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGGP02679 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGGP02679 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGGP02679 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGGP02679 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGGP02679 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGGP02679 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGGP02679 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FGGP02679 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGGP02679 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FGGP02679 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGGP02679 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGGP02679 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGGP02679 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGGP02679 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGGP02679 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGGP02679 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGGP02679 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGGP02679 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGGP02679 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGGP02679 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGGP02679 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGGP02679 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGGP02679 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FGGP02679 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FGGP02679 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGGP02679 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGGP02679 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGGP02679 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGGP02679 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGGP02679 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGGP02679 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGGP02679 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGGP02679 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGGP02679 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGGP02679 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGGP02679 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGGP02679 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FGGP02679 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGGP02679 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FGGP02679 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGGP02679 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms