Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC3P02656 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC3P02656 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC3P02656 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC3P02656 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC3P02656 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC3P02656 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC3P02656 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC3P02656 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC3P02656 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC3P02656 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC3P02656 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC3P02656 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC3P02656 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC3P02656 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC3P02656 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC3P02656 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC3P02656 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC3P02656 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC3P02656 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC3P02656 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC3P02656 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC3P02656 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC3P02656 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC3P02656 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC3P02656 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC3P02656 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC3P02656 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC3P02656 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC3P02656 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC3P02656 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC3P02656 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC3P02656 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC3P02656 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC3P02656 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC3P02656 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC3P02656 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC3P02656 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC3P02656 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC3P02656 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC3P02656 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC3P02656 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC3P02656 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC3P02656 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC3P02656 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC3P02656 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC3P02656 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC3P02656 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC3P02656 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC3P02656 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC3P02656 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC3P02656 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC3P02656 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC3P02656 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC3P02656 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC3P02656 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC3P02656 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC3P02656 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC3P02656 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC3P02656 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC3P02656 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC3P02656 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC3P02656 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC3P02656 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC3P02656 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC3P02656 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC3P02656 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC3P02656 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC3P02656 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC3P02656 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC3P02656 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC3P02656 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC3P02656 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC3P02656 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC3P02656 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC3P02656 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC3P02656 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC3P02656 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC3P02656 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC3P02656 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC3P02656 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC3P02656 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC3P02656 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC3P02656 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC3P02656 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC3P02656 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC3P02656 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC3P02656 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC3P02656 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC3P02656 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC3P02656 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC3P02656 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC3P02656 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC3P02656 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC3P02656 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC3P02656 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC3P02656 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC3P02656 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC3P02656 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC3P02656 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms