Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.5 ms