Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HLA-DRAP01903 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DRAP01903 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DRAP01903 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms