Protein–RNA interactions for Protein: P01850

TRBC1, T-cell receptor beta-1 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC1P01850 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBC1P01850 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBC1P01850 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBC1P01850 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBC1P01850 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBC1P01850 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBC1P01850 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBC1P01850 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBC1P01850 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBC1P01850 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBC1P01850 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBC1P01850 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBC1P01850 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBC1P01850 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBC1P01850 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBC1P01850 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBC1P01850 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRBC1P01850 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms