Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F9P00740 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
F9P00740 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F9P00740 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F9P00740 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
F9P00740 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F9P00740 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F9P00740 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
F9P00740 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F9P00740 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F9P00740 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
F9P00740 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F9P00740 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
F9P00740 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
F9P00740 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
F9P00740 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
F9P00740 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
F9P00740 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
F9P00740 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
F9P00740 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
F9P00740 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
F9P00740 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
F9P00740 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
F9P00740 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
F9P00740 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
F9P00740 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
F9P00740 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
F9P00740 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
F9P00740 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
F9P00740 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
F9P00740 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
F9P00740 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
F9P00740 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
F9P00740 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
F9P00740 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
F9P00740 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
F9P00740 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
F9P00740 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
F9P00740 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F9P00740 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
F9P00740 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F9P00740 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
F9P00740 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F9P00740 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F9P00740 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F9P00740 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
F9P00740 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
F9P00740 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
F9P00740 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
F9P00740 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
F9P00740 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F9P00740 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
F9P00740 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F9P00740 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
F9P00740 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
F9P00740 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
F9P00740 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
F9P00740 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
F9P00740 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
F9P00740 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
F9P00740 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
F9P00740 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
F9P00740 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
F9P00740 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
F9P00740 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
F9P00740 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
F9P00740 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
F9P00740 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
F9P00740 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
F9P00740 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
F9P00740 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
F9P00740 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
F9P00740 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
F9P00740 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
F9P00740 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
F9P00740 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
F9P00740 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
F9P00740 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
F9P00740 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
F9P00740 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
F9P00740 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
F9P00740 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
F9P00740 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
F9P00740 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
F9P00740 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
F9P00740 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
F9P00740 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
F9P00740 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
F9P00740 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
F9P00740 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
F9P00740 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
F9P00740 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
F9P00740 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
F9P00740 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
F9P00740 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
F9P00740 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
F9P00740 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
F9P00740 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
F9P00740 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
F9P00740 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms