Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP4O95707 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP4O95707 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP4O95707 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP4O95707 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP4O95707 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP4O95707 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP4O95707 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP4O95707 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP4O95707 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP4O95707 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP4O95707 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP4O95707 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POP4O95707 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POP4O95707 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POP4O95707 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POP4O95707 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POP4O95707 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POP4O95707 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP4O95707 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP4O95707 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP4O95707 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP4O95707 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POP4O95707 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP4O95707 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP4O95707 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP4O95707 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP4O95707 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP4O95707 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POP4O95707 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP4O95707 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP4O95707 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP4O95707 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP4O95707 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP4O95707 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP4O95707 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POP4O95707 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP4O95707 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP4O95707 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP4O95707 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP4O95707 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP4O95707 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP4O95707 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP4O95707 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP4O95707 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP4O95707 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP4O95707 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP4O95707 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP4O95707 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POP4O95707 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP4O95707 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP4O95707 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POP4O95707 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP4O95707 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP4O95707 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP4O95707 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP4O95707 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP4O95707 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POP4O95707 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POP4O95707 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POP4O95707 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POP4O95707 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POP4O95707 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POP4O95707 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POP4O95707 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POP4O95707 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POP4O95707 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POP4O95707 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POP4O95707 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POP4O95707 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP4O95707 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP4O95707 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP4O95707 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP4O95707 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP4O95707 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP4O95707 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP4O95707 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP4O95707 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP4O95707 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POP4O95707 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP4O95707 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP4O95707 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP4O95707 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP4O95707 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP4O95707 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP4O95707 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP4O95707 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP4O95707 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP4O95707 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP4O95707 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP4O95707 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP4O95707 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP4O95707 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP4O95707 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP4O95707 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP4O95707 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP4O95707 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP4O95707 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP4O95707 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP4O95707 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms