Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D2O95562 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D2O95562 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D2O95562 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D2O95562 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFT2D2O95562 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFT2D2O95562 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFT2D2O95562 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFT2D2O95562 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFT2D2O95562 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms