Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC24DO94855 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC24DO94855 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC24DO94855 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEC24DO94855 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEC24DO94855 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEC24DO94855 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEC24DO94855 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEC24DO94855 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEC24DO94855 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24DO94855 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
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