Protein–RNA interactions for Protein: O76070

SNCG, Gamma-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCGO76070 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCGO76070 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCGO76070 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCGO76070 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCGO76070 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCGO76070 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCGO76070 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCGO76070 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCGO76070 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCGO76070 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCGO76070 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCGO76070 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCGO76070 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCGO76070 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCGO76070 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCGO76070 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCGO76070 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCGO76070 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCGO76070 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCGO76070 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCGO76070 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCGO76070 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCGO76070 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCGO76070 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCGO76070 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCGO76070 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNCGO76070 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCGO76070 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCGO76070 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCGO76070 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCGO76070 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCGO76070 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCGO76070 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCGO76070 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCGO76070 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCGO76070 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCGO76070 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCGO76070 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCGO76070 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNCGO76070 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNCGO76070 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNCGO76070 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNCGO76070 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNCGO76070 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNCGO76070 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNCGO76070 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNCGO76070 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNCGO76070 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNCGO76070 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNCGO76070 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNCGO76070 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNCGO76070 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNCGO76070 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNCGO76070 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNCGO76070 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNCGO76070 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNCGO76070 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNCGO76070 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNCGO76070 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNCGO76070 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNCGO76070 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNCGO76070 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNCGO76070 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNCGO76070 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNCGO76070 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNCGO76070 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNCGO76070 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNCGO76070 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNCGO76070 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNCGO76070 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNCGO76070 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNCGO76070 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNCGO76070 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNCGO76070 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNCGO76070 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNCGO76070 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNCGO76070 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCGO76070 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCGO76070 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCGO76070 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCGO76070 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCGO76070 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCGO76070 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCGO76070 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCGO76070 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCGO76070 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCGO76070 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCGO76070 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCGO76070 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCGO76070 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCGO76070 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCGO76070 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCGO76070 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCGO76070 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCGO76070 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCGO76070 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCGO76070 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCGO76070 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCGO76070 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCGO76070 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms