Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEBLO76041 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEBLO76041 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NEBLO76041 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NEBLO76041 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEBLO76041 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEBLO76041 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEBLO76041 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEBLO76041 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEBLO76041 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEBLO76041 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEBLO76041 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEBLO76041 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEBLO76041 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEBLO76041 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEBLO76041 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEBLO76041 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEBLO76041 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEBLO76041 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEBLO76041 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEBLO76041 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEBLO76041 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEBLO76041 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEBLO76041 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEBLO76041 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEBLO76041 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEBLO76041 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEBLO76041 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NEBLO76041 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NEBLO76041 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEBLO76041 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEBLO76041 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEBLO76041 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEBLO76041 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEBLO76041 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEBLO76041 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEBLO76041 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEBLO76041 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEBLO76041 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEBLO76041 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEBLO76041 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEBLO76041 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEBLO76041 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEBLO76041 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEBLO76041 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEBLO76041 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEBLO76041 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEBLO76041 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEBLO76041 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEBLO76041 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEBLO76041 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEBLO76041 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NEBLO76041 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEBLO76041 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEBLO76041 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEBLO76041 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEBLO76041 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEBLO76041 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEBLO76041 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEBLO76041 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEBLO76041 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEBLO76041 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEBLO76041 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEBLO76041 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEBLO76041 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEBLO76041 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEBLO76041 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEBLO76041 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEBLO76041 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEBLO76041 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEBLO76041 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEBLO76041 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEBLO76041 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEBLO76041 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEBLO76041 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEBLO76041 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEBLO76041 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEBLO76041 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEBLO76041 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEBLO76041 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEBLO76041 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEBLO76041 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEBLO76041 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEBLO76041 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEBLO76041 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEBLO76041 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEBLO76041 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEBLO76041 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEBLO76041 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEBLO76041 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEBLO76041 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEBLO76041 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEBLO76041 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEBLO76041 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEBLO76041 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEBLO76041 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEBLO76041 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEBLO76041 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEBLO76041 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEBLO76041 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms