Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN3O75935 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms