Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LGR5O75473 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LGR5O75473 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LGR5O75473 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LGR5O75473 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LGR5O75473 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LGR5O75473 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LGR5O75473 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGR5O75473 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGR5O75473 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGR5O75473 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGR5O75473 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGR5O75473 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGR5O75473 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGR5O75473 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGR5O75473 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGR5O75473 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGR5O75473 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGR5O75473 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGR5O75473 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGR5O75473 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGR5O75473 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGR5O75473 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGR5O75473 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LGR5O75473 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGR5O75473 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGR5O75473 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LGR5O75473 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LGR5O75473 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGR5O75473 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LGR5O75473 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGR5O75473 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGR5O75473 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGR5O75473 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGR5O75473 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGR5O75473 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGR5O75473 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGR5O75473 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGR5O75473 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGR5O75473 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGR5O75473 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGR5O75473 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGR5O75473 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGR5O75473 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGR5O75473 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGR5O75473 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGR5O75473 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGR5O75473 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGR5O75473 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGR5O75473 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGR5O75473 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LGR5O75473 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LGR5O75473 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LGR5O75473 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LGR5O75473 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LGR5O75473 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LGR5O75473 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LGR5O75473 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LGR5O75473 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LGR5O75473 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LGR5O75473 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LGR5O75473 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LGR5O75473 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGR5O75473 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGR5O75473 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGR5O75473 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGR5O75473 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGR5O75473 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGR5O75473 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGR5O75473 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGR5O75473 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LGR5O75473 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGR5O75473 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGR5O75473 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGR5O75473 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGR5O75473 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGR5O75473 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGR5O75473 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGR5O75473 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGR5O75473 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGR5O75473 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGR5O75473 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGR5O75473 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGR5O75473 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGR5O75473 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGR5O75473 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGR5O75473 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LGR5O75473 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGR5O75473 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGR5O75473 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGR5O75473 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGR5O75473 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGR5O75473 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGR5O75473 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGR5O75473 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGR5O75473 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGR5O75473 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGR5O75473 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGR5O75473 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGR5O75473 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms