Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PMPCBO75439 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms