Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSVO60911 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSVO60911 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSVO60911 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSVO60911 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSVO60911 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSVO60911 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSVO60911 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSVO60911 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSVO60911 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSVO60911 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSVO60911 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSVO60911 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSVO60911 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSVO60911 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSVO60911 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSVO60911 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSVO60911 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSVO60911 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSVO60911 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSVO60911 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSVO60911 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSVO60911 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSVO60911 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSVO60911 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSVO60911 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSVO60911 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSVO60911 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSVO60911 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSVO60911 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSVO60911 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSVO60911 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSVO60911 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSVO60911 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSVO60911 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSVO60911 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSVO60911 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSVO60911 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSVO60911 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSVO60911 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSVO60911 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSVO60911 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTSVO60911 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSVO60911 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSVO60911 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSVO60911 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSVO60911 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSVO60911 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSVO60911 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSVO60911 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSVO60911 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSVO60911 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSVO60911 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSVO60911 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSVO60911 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSVO60911 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSVO60911 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSVO60911 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSVO60911 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSVO60911 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSVO60911 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSVO60911 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSVO60911 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSVO60911 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSVO60911 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSVO60911 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSVO60911 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSVO60911 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSVO60911 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSVO60911 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSVO60911 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSVO60911 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSVO60911 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSVO60911 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSVO60911 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSVO60911 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSVO60911 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSVO60911 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSVO60911 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSVO60911 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSVO60911 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSVO60911 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSVO60911 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSVO60911 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSVO60911 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSVO60911 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSVO60911 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSVO60911 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSVO60911 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSVO60911 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSVO60911 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSVO60911 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSVO60911 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSVO60911 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSVO60911 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSVO60911 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSVO60911 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSVO60911 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSVO60911 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSVO60911 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms