Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPINK4O60575 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINK4O60575 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINK4O60575 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINK4O60575 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms