Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL4O60488 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSL4O60488 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms