Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAK2O60296 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAK2O60296 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms