Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DHX16O60231 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DHX16O60231 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DHX16O60231 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DHX16O60231 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DHX16O60231 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DHX16O60231 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DHX16O60231 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DHX16O60231 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DHX16O60231 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DHX16O60231 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DHX16O60231 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DHX16O60231 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DHX16O60231 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DHX16O60231 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DHX16O60231 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DHX16O60231 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DHX16O60231 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DHX16O60231 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DHX16O60231 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DHX16O60231 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DHX16O60231 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DHX16O60231 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DHX16O60231 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DHX16O60231 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DHX16O60231 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DHX16O60231 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DHX16O60231 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DHX16O60231 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DHX16O60231 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DHX16O60231 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DHX16O60231 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DHX16O60231 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DHX16O60231 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DHX16O60231 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DHX16O60231 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DHX16O60231 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DHX16O60231 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DHX16O60231 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DHX16O60231 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DHX16O60231 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DHX16O60231 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DHX16O60231 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DHX16O60231 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DHX16O60231 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DHX16O60231 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DHX16O60231 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DHX16O60231 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DHX16O60231 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DHX16O60231 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DHX16O60231 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DHX16O60231 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DHX16O60231 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DHX16O60231 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DHX16O60231 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX16O60231 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX16O60231 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX16O60231 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX16O60231 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX16O60231 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX16O60231 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX16O60231 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX16O60231 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX16O60231 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX16O60231 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX16O60231 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX16O60231 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX16O60231 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX16O60231 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX16O60231 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DHX16O60231 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DHX16O60231 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DHX16O60231 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DHX16O60231 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DHX16O60231 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DHX16O60231 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DHX16O60231 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DHX16O60231 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DHX16O60231 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DHX16O60231 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DHX16O60231 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DHX16O60231 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DHX16O60231 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DHX16O60231 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DHX16O60231 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DHX16O60231 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DHX16O60231 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DHX16O60231 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
DHX16O60231 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DHX16O60231 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DHX16O60231 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DHX16O60231 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DHX16O60231 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DHX16O60231 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DHX16O60231 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DHX16O60231 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DHX16O60231 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DHX16O60231 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DHX16O60231 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DHX16O60231 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms