Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC28A2O43868 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC28A2O43868 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC28A2O43868 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC28A2O43868 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC28A2O43868 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC28A2O43868 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC28A2O43868 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC28A2O43868 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC28A2O43868 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC28A2O43868 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC28A2O43868 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC28A2O43868 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC28A2O43868 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC28A2O43868 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC28A2O43868 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms